Xây dựng Viện trở thành một trung tâm hàng đầu tại Việt Nam và các nước trong khu vực ở các lĩnh vực:  nghiên cứu sức khoẻ cộng đồng, hỗ trợ và tư vấn kỹ thuật về nghiên cứu khoa học, đẩy mạnh sự kết nối mạnh mẽ giữa trường Đại học và Cộng đồng.

Thực hiện các nghiên cứu hợp tác chất lượng cao, cung cấp dịch vụ tư vấn kỹ thuật và bằng chứng khoa học cho các hoạt động can thiệp nhằm nâng cao sức khoẻ cộng đồng. 

1. Thiết lập và phát triển mạng lưới hoạt động của Viện, lập  kế hoạch dài hạn nhằm đảm bảo tính bền vững
2. Nâng cao kỹ năng nghiên cứu và đánh giá cho cán bộ y tế trong lĩnh vực chăm sóc sức khoẻ cộng đồng ở các  tỉnh can thiệp khu vực Miền Trung – Tây nguyên
3. Thực hiện các nghiên cứu hợp tác đa ngành và đẩy mạnh  thực hành dựa vào bằng chứng trong chăm sóc sức khỏe cộng đồng
4. Mở rộng sự tiếp cận thông tin y tế
5. Nâng cao chất lượng thủ tục xét duyệt đạo đức nghiên cứu

• Phát triển mạng lưới hợp tác hoạt động của Viện với các đối tác trong nước (đối tác chính bao gồm 5 tỉnh can thiệp khu vực miền Trung-Tây nguyên) và quốc tế  
• Tổ chức các hội thảo, khoá tập huấn kỹ thuật về các chủ đề dựa trên nhu cầu của đối tác ở các tỉnh  và các hội thảo/tập huấn về lập kế hoạch chiến lược, thực hành dựa vào bằng chứng, đạo đức nghiên cứu.
• Phát triển mạng lưới dịch vụ tư vấn và đánh giá các công trình /dự án nghiên cứu khoa học và chăm sóc sức khoẻ cộng đồng
• Tư vấn kỹ thuật, đánh giá và hỗ trợ kinh phí cho các các dự án nghiên cứu trong và ngoài trường, dự án nghiên cứu tại 5 tỉnh can thiệp khu vực Miền Trung-Tây nguyên
• Thực hiện các  dự án nghiên cứu chất lượng cao trong lĩnh vực y tế công  cộng, các dự án nghiên cứu  với  quy mô lớn thông qua tìm kiếm các nguồn tài trợ từ bên ngoài và các dự án nghiên cứu sau đại học .
• Tăng cường ‘Thực hành dựa vào bằng chứng’ trong công tác chăm sóc sức khỏe cộng đồng (thông qua hỗ trợ cho các nghiên cứu về đánh giá các dịch vụ y tế…)
• Tham gia hỗ trợ công tác biên tập và phản biện nhằm nâng cao chất lượng tạp chí Y Dược học trường Đại học Y Dược Huế.
• Hỗ trợ mối liên kết giữa nghiên cứu viên tại các tỉnh với Trung tâm học liệu trường Đại học Y Dược Huế, bao gồm tập huấn kỹ thuật về kỹ năng tìm kiếm thông tin, tài liệu tham khảo…
• Tổ chức các diễn đàn sinh hoạt, festival khoa học thường niên tại cộng đồng
• Công bố các kết quả nghiên cứu khoa học của Viện tại các hội nghị/tạp chí trong và ngoài nước.
• Phát triển và duy trì trang web của Viện, liên kết và chia sẻ thông tin với các đối tác 
• Tổ chức hội thảo, tập huấn về ‘Ứng dụng các tiêu chuẩn quốc tế trong xét duyệt /đánh giá đạo đức nghiên cứu‘ cho Hội đồng phản biện của Viện và đối tác tại các tỉnh. Duy trì hoạt động xét duyệt đạo đức nghiên cứu với chất lượng cao thông qua giám sát của các chuyên gia Việt nam và Australia
• Phát triển, giới thiệu hệ thống thông tin điện tử và tổ chức các cuộc họp thường kỳ Hội đồng đánh giá Viện và Hội đồng đạo đức nghiên cứu trường Đại học Y Dược Huế